松山出身的将领没有炮兵出身，对于如何使用火炮也不是太了解，降将中倒有两个出身炮兵，不过大勇无意将炮兵营交给降将统带。营官人选他属意邵武这个在松山就追随自己的老部下，但邵武奉命回锦州调兵，所以大勇再三考虑后，还是以宋庆暂代营官人选。
五个千户的人选也选了三个松山出身的军官，分别是原松山把总董忠、原松山卫左前堡百户吴国清、原松山卫签押官杨磷。另外两个则委给了降将中火器新军负责炮队炮的高怀和沈义。另外大勇还给新成立的炮兵营配了十几个教官，这些教官便是在登州城破后被叛军掳去的葡萄牙军官。
孙元化当初为了使新编火器新军尽快形成战斗力，除了重金从澳门采购大炮火绳枪外，还聘请了一批教官和工匠。登州城破时，葡人军官总教习特谢拉??科雷亚和11名手下为大明战死，另有菲斯克等15人为叛军效命。李忠辅、耿仲明杀毛承禄投降后，菲斯克等人便成了锦州军的俘虏。对于这些万里迢迢来东方发财的异族人，大勇并不是太重视，既没杀掉他们也没有释放他们的意思。原先是想等朝廷派人接收登州时将他们交给朝廷处置，现在却是有了让他们发挥所长的机会。
火绳枪的使用已经不劳这些洋教习再教了，火炮的使用倒还需他们再卖点力。和孙元化一样，大勇给这些葡人军官也开出了重金饷银，和那些屯田青壮一样，大勇也明确告诉这些葡人军官只要在锦州军效劳满三年便可离开，届时还有路费相赠。菲克斯等人对这个条件十分的满意，他们在国内都是没落户，若是有门路也不会冒着死在大海上的风险万里迢迢来东方求财了。本来被叛军掳获后，他们为了保命替叛军做了不少事，也跟着干了不少杀人洗劫的罪行，原以为能趁势发笔大财，不想叛军这么快就被大明的官军击败，他们也成了俘虏。想到自己之前做的事情，菲克斯等人就没了什么活命的念头。不想这位大明的残脸将军非但没有治他们的罪，反而仍继续重金聘用他们，这使得一众葡人心生感激，不迭表示一定死心塌地为大明、为将军服务。
待菲克斯等人满怀感激的出帐后，大勇却扭头吩咐郭义：“三年期满，把这帮白杂碎剁了喂狗。”
从澳门来的工匠原先有一百多人，可惜叛军入城后，对这些长相一样的同胞没有手下留情，除了三个翻译和七个一直和葡人军官呆在一起的工匠，其他人都被杀了。炮兵营成立后，大勇为了日后火器的维护，也将这些工匠留用，另外在俘虏中找出一些工匠，凑齐一百人后在水城中找了块场地作为锦州军的武器维护局所在。不过，现在这个维护局还是个空架子，也没多少兵器让他们维修，也缺少原料工具，大勇对这方面的事情也不是太精通，所以想着等锦州的麻忠过来后再梳理维护局的事情，争取能将这个维护局发展成锦州军的兵工厂。现在，就暂且养着这帮人，交给他们一些农具打造和维修的小事做着先吧。
新编火器新营两个，每营4000人，士兵配置为新式火绳枪一杆，腰刀一把，棉甲一幅。两个火器新营仍以火器左营和火器右营命名，营官分别是左营蒋万里、右营李大山。八个千户人选锦州军官占了四个，余下四个则由降将李忠辅、郑泰、向宠、杜道担任。百户和总旗军官的任命也基本上一半对一半。如此安排，是为了拉拢这些降将安心替锦州军效命，毕竟他们原先的部下很多都在这些改编之中，若是降将一个不用，难免引起这些降兵们的担心。而且大勇相信这些个降将和那些战兵们也并非真的是不堪一战的废物，他们能够将北地闹出这么大的动静，吓得官军远远望风而逃就证明了他们的战斗力。之所以失败，只不过是遇上了更强的锦州军而矣，只要加以改造，让他们融入锦州军这个大集体中，这些人还是能够发挥出不容小瞧的强悍战斗力的。
让一只羊带领一群狼，那肯定是不堪入目，但让一只狼带领一群羊，那就让人刮目相看了，况且锦州军也不是一只狼，而是一群狼，这些降兵降将也不是一群羊，他们是曾经和东虏厮杀过的狼。只要唤起他们的狼性，他们依旧是让对手忌惮的群狼。
辎重营也进行了扩充，全营战兵1000，辅兵4000，也编五千户，营官指挥使由沙河反正的齐三宝担任，王天德则出任副指挥使领第一千户战兵。全营配大小马车300辅，就目前而言，辎重营的任务基本就是运送粮草，并不需投入战事。武器配置是战兵新式火绳枪一杆，佩腰刀一把，辅兵只佩旧式火铳一杆，不另配武器。
以上四营，炮兵营5000人，两个步军营8000人，辎重营5000人，合计18000人，再加上曹变蛟的狼骑军，五军已经合计20500人。
大勇的亲兵营没有动，仍是800人，四个营官郭城、李固、王飞、林俊义都是千户衔，也仍然是由大勇直领。之所以没有扩充自己的亲兵营，是因为大勇不想和大明其他军将一样将所有资源都拿来打造自己的亲兵，忽视其他士兵，使军中大多数士兵只能沦为辅兵。如此军队在战场上很难做到上下一心，一旦亲兵队伍被击溃，胜负也就决出。对这样的战场模式，大勇显然是不满意的，他希望自己的士兵都是一样的精锐，都能一样的在战场上拼命，而不是沦为摇旗呐喊的角色。
郭义没有被大勇下放到营中任职，大勇继续将他留在自己身边统领50人的贴身亲卫，如此安排，还是因为大勇觉得郭义太小的缘故。算上虚岁，郭义其实也才16岁，大勇还是想将再留在身边几年再放出去。对这样的安排，郭义倒没有怨言，他11岁时便到大勇哥哥大智身边服侍，大智死后又到大勇身边，潜意识里已经将大勇兄弟当作自己的兄长。目睹大智的惨死后，郭义更是不想再看到大勇也战死，因此他想着留在大勇身边，将来万一危险时，自己说不定也能替大勇挡下致命的一箭。
全军经这次改编扩充，全军兵员近21500人，眼下登州的存粮有260万石，一石粮约120斤，若不计百姓，足以支撑锦州军十年所需，计上百姓，也能顶上四五年。再加上屯田正在进行，大勇一直担心的缺粮问题除非遇到什么大的变故，否则完全不必再担心。
整编用了七天时间，这段时间内大勇一步也没出过水城，直到整编完成，他才松了口气准备到钱大刚的登州水师看看。不想城里的宋光兰却派人急匆匆的跑来告诉他京师来人了。
京师来人了？圣旨到了？大勇一惊，高起潜眼下应该还没到京，京里没那么快就派人来登州啊，难道出了什么变故？
想到这些日子自己对登州和锦州军付出的心血，大勇不由一个激灵，他很怕朝廷已经派人来接收登州，也怕朝廷知道他的举动后会命他返回锦州，使他的辛苦尽付诸水流。
降将们也知道京里来人了，一时全跑到大勇的军帐，一个个都是万分紧张，大勇安抚了他们几句，给曹变蛟和蒋万里他们打了眼色，不动声色的带着自己的亲卫骑马返回城中。
还没到城门，就见王徽和宋诚等降官早已等在那，看到大勇的身影，他们就如同见了爹娘老子一样巴巴的跑了过来，你一言我一语的，说的都是他们这些日子来没有功劳也有苦劳，眼下朝廷派人来了，还请施将军能够履行对他们的诺言，保他们全家性命。
大勇自己都不知道京中来人是干什么来了，心里也担心，但还是安抚了降官们，让他们不必惊虑且去忙自己的差事，一切都有他担当，施大勇不是无信之人。话虽是这么说，但降官们哪个能安得了心，事情不到头上尚还能自我安慰，现下事到临头，他们如何还能自我安慰说没事的。且护送京里来人的是锦衣卫的一队兵卒，这让他们更是害怕。有明一代，官员犯事可大多都是由锦衣卫的人给逮捕的，如今来登州的就是锦衣卫，虽说当今天子登基后已经裁撤锦衣卫和东厂，但瘦死的骆驼比马大，掉毛的老虎也咬人，他们犯得又是比贪桩枉法更要命的叛国罪，能不怕吗！
又安抚了几句，见降官们仍是惶恐不安，大勇便也不理会他们，扬鞭就进了城。进城之后直奔巡抚衙门，宋光兰派的人报信时说宋大人已经将京里来人全安排在了巡抚衙门。