在武器弹药方面，借着崇明和嵊泗列岛扼我国18000公里的海岸线的中心，处长江、钱塘江的交会要害，黄复华以十五文一斤，购得从日本运来的硫磺上万斤；以每百斤1.5两的价格大量收购佛山等地来的生铁和铁器。
卫队和水军全部实现火器化，手榴弹，子弹，炮弹等不再有短缺之虞。
前述的1600公斤大铁炮成为一六三一式岸防重炮，最远射程达到了七八里。不过，此炮并没有大规模铸造，1631年全年仅造四门，全部部署在嵊泗列岛。
黄复华为了增加通用性，减少弹药补给的难度，决定暂时只大规模制造一种口径的火炮。
一六三一式步兵火炮，弹径约为78毫米，与89毫米外径的钢炮保持一致的弹径，炮管重量达到260公斤，最远射程约有1000米，弹重达到1.2公斤，装药量0.5公斤，为开花弹。黄复华特别重视炮车的建造和改进，配上的炮车重250公斤，不仅牢固可靠，可以较为方便地调节仰角和左右方向，还使用了橡胶做成的实心轮胎，灵活机动。
一六三一式海军火炮，弹径还是78毫米，与步兵炮一致。但炮管长度和厚度，以及炮弹重量，装药量都相对减少，最大射程仅有500米左右。因为海上要打击的是移动目标，而在这个时代要击中太远的移动靶，只能是靠大神保佑。
在船只方面，1631年全年新增各类小型船只和辅助船只二十余艘。如“联环舟”，“其舟约四丈许，外视之若一舟，分则为二舟，前半截三之一，后半截三之二，中联以环，前截载火炮、神烟、神砂、毒火等器，首装大倒须钉数枚，锐向其利，后截二夯施数桨，载兵士”。这种“联环舟”在作战时，“以首钉撞于敌舟之上，前环自解，后载则回”。
另外，新造或改装排水量100~150吨左右的战船三艘，这些船的身长在20米到30米之间，宽6米到7米之间，深2米到2.5米之间。不过，这些战船并不是很耐用，估计使用寿命也就六到七年，黄复华准备用满五年就更换。还购得了宁波府五百料战船一艘，船身长12.25丈，面阔3丈，深1.15丈。
1631年3月10日，黄复华以自己的两条四百料武装沙船和雇得的一条六百料大沙船，共载米近两百吨，组成了海运船队。黄复华请来1597年（明万历二十五年）参加过运载沙兵，东援朝鲜行动，经验丰富，年近五十的船老大陈瀛为押运指引，开始了恢复元代海运的征程。
说到元代海运，必须提到一个人。朱清，生于1236年，卒于1306年，字澄叔，崇明县姚沙人。原来是一个姓杨的大户的家奴，后来杀了主人而只能避迹海上，沦为海盗。再后来受到宋朝朝廷的招安，南宋灭亡后，朱清就降了元朝。至元十二年（1275年），朱清任运管军千户。至元十三年，1276年，奉元朝丞相的命令，朱清将南宋库藏图籍运至大都。至元十九年，朝廷寻求南粮北调的运输路线时，朱清和张瑄建议海运。两人移居太仓，与上海总管罗壁造出平底海船60艘，自刘家港运粮4万石至大都，开创了元代海运。以后，运粮数逐年增加，最高达三百多万石。
根据《元朝的海运》一文记载，海运航线前后有三次变更：
第一次航路，从至元十九年首次粮运，到至元二十八年新航路的开辟，共沿用十年。航线大体是：从刘家港（今江苏太仓浏河镇）至海门黄连沙头（在今江苏启东东部海中）、万里长滩（在今江苏启东东部，西南向呈长条形，后来部分形成陆地），经盐城（今属江苏，当时濒海），历海宁府（治今江苏连云港西南）界，可至莺游山（今连云港东北东西连岛），下入山东境，由密州（治今诸城）入胶州（治今胶县）界放灵山洋（今青岛南、胶南以东海面），北至浮山（青岛附近）、劳山（青岛东北崂山）、福山（崂山县东），沿海岸达延真岛（今山东荣成沿津岛），东北转过成山（在今荣成成山角），最后进入天津界河口。该航线沿海岸航行，迂回曲折，委实水路艰难，深为繁重”，航期长达两个多月。
第二次航路，至元二十九年由朱清聘请长兴（属今浙江）李福四“押运指引”，路线是：从刘家港开洋，转过撑脚沙（在今江苏常熟璜泾北江中），至三沙洋子江（在今江苏崇明西北，后来大部分形成陆地），东北至扁担沙大洪（今启东东南，今已成陆地）、万里长滩，再往东北一千里至清水洋、黑水洋，过黑水洋可见延真岛。西北至成山与刘岛（今山东威海东刘公岛）、芝罘岛（在今山东烟台北）诸岛，进入天津界河。该航道从万里长滩到成山一段取远海航行，线路较为径直。一路顺风，半月可达目的地；风水不便，则需要一个月或四十天以上。
第三次航路，至元三十年开辟，从刘家港出发，过黄连沙转西，东北取道成山，“亦为不便”，故“继为千户殷明略踏开生路”。这条新航道是：从刘家港出发至崇明三沙，东行入黑水大洋至成山，以下大致与至元二十九年新航路同。航船至崇明三沙后，避开万里长滩直入黑水洋，取远海航行，顺风十日即可驶达。此后海运均取这条航道。
第二条航路里出现的清水洋、黑水洋，都是黄海的古称之一。宋朝以来，我国的航海者对于今天的黄海分别称之为黄水洋、青水洋和黑水洋。在长江口附近一带，海面含沙较多，水呈黄色，称为黄水洋；北纬34°、东经122°附近一带海水较浅，水呈绿色，称为青水洋；北纬32°－36°、东经123°以东一带海水较深，水呈蓝色，称为黑水洋。
元代海运江南的粮食，分成春、夏二运。新航道开辟前，一般是正月集粮，二月起航，四月达天津，五月返航运夏粮，八月返港。改道后，航期缩短，一般是三月起运。
这次海运，除了以船老大陈瀛为指引，黄复华还派出黄炜，吴谱，潘时键，黄邰，曹从质等人跟从学习，测绘航海图。黄复华提供了根据现代中国沿海地图转成的海图，除了南通这些地方的海岸线发生了一些变化，其它的没什么大变化，精度足够高了。
黄复华给船队提供了高精度的指南针，还有二十元买的电子表等仪器。
“现在时间十二点整，航向正北，测定航速！”
“新法约6.7节，西法六到七节！”
黄炜在海图上按照6.7节用铅笔做了相应标记。这些学徒们分别在三条船上各自测绘海图，以免一人做图出错。
在古代，中国航海本来用如下的方法测量航速：船在航行时，自船首扔下测量用的木片；人从船首快步走向船尾，要是人、木片同时到船尾，称上更。此时行驶一更时间，也就是2.4小时，为六十里。即航速约六、七节。人先到为不上更，木先到为过更。
这种测量方法反应了当时人们已经对运动的相对性有了很好的认识。可惜士大夫阶层认为这些东西都是奇技淫巧，没有人深入思考并加以表述总结。
更本意只是一个计时单位，又作为计程单位，《西洋朝贡典录》称：“海行之法，六十里为一更。”《筹海图志》说：更者，每一昼夜分为十更，以焚香支数为度。”参考《郑和航海图》中的某些记载，可以估算出郑和船队的平均有效航速。“官屿溜用庚酉针二百五十更收姆骨都束”，这个是25天实际航程1656海里。从“官屿用单甲针45更船收小葛兰”，这个是4.5天航程330海里。这样算起来，有效航速就是在三节上下了，由于航行中航向受风向的影响，船只行驶的方向不可能一直和航向一致，实际航速应当在4节到5节之间。
节是西方水手用于测量船的航行速度的一种计量单位，目前已经演变成世界通用的航海术语和速度标准单位。1节规定为1海里/小时。
海里是海上的长度单位。它原指地球子午线上纬度1分的长度，由于地球略呈椭球体状，不同纬度处的1分弧度略有差异，在赤道上1海里约等于1843米，两极约等于1861.6米。1929年国际水文地理学会议，通过用1分平均长度1852米作为1标准海里的长度。
当然，节的说法最开始并不是指什么地球纬度的1分长度。在西方古代水手使用节作为航行速度单位的时候，还不知道地球是圆的，还是扁的呢。十六世纪时，海上航行已相当发达，但当时一无时钟，二无航程记录仪，难以确切判定船的航行速度。有聪明的水手就想出一个妙法，用一根长绳，等距离打上结，一头栓在船尾（侧后方比较好）沉入海中。当船航行时，绳子会因阻力而部分漂上海面，船速越快，漂上海面的部分就越长。水手根据露出水面的绳结的数量来测算航速，“节”作为航速单位由此而来。